蛋白酶解（proteolysis）是指蛋白质在蛋白酶催化下分解为多肽或氨基酸的过程 ，属于细胞科学领域，应用于生物水解及工业生产 。该过程通过水解肽键实现，受控条件下发生于溶酶体内，细胞受损时则引发自溶 。
蛋白酶根据作用pH分为酸性、中性和碱性蛋白酶 。中性蛋白酶在中性环境催化蛋白质水解，应用于食品加工、皮革脱毛及环保治理 ；碱性蛋白酶用于洗涤剂和乳蛋白水解 。胰蛋白酶因高特异性广泛用于蛋白质组学研究 。
工业上，蛋白酶解用于改善原料功能性，如水解小麦蛋白生成谷氨酰胺肽 ，或通过融合蛋白酶解纯化目标蛋白 。技术进步包括基因编辑优化酶特异性及酶固定化技术应用 。
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