世界卫生组织推荐接种HPV疫苗的主要目标年龄人群是9~14岁，即在进入性活跃期之前。因为HPV疫苗用于无HPV暴露史者最为有效。
而美国食品和药品管理局（FDA）也批准了9价HPV疫苗的补充申请，将适用人群从之前的9-26岁扩大到27-45岁的女性和男性。
但因全球所有药品申请上市时，都是基于研究结果来确定适用年龄的。内地的9价HPV疫苗只针对16岁到26岁的女性做了实验，所以存在年龄限制。
实际上，我国女性高危型HPV感染按照年龄划分有两个高峰，分别为：26-30岁（18.7%）、40岁以上的女性（16%）。
