成都金沙遗址博物馆的两大主体建筑为遗迹馆和陈列馆，外形都采用了斜坡的方式，喻示着金沙遗址的冉冉升起。遗迹馆为近圆形，陈列馆为方形，一圆一方象征着中国古人天圆地方的宇宙观。两座建筑分布在摸底河的南北两岸，与园林区融为一体。成都金沙遗址博物馆也成为了成都市的地标性建筑。
成都金沙遗址博物馆的园林区以“自然之美，草野之趣”为设计理念，绿化覆盖率高达80%，是博物馆的有机组成部分。在园林区中，树木和植被根据不同的特点划分为不同区域。主要游览道路两旁栽种了四川盆地非常古老的树种银杏、水杉、针楠等；樱花林、桃花林、梨花林、芙蓉林、腊梅林等点缀在园区各处；竹林、灌木簇拥在博物馆建筑周围。
成都金沙遗址博物馆陈列馆屋顶的设计被建筑师融入了金沙和考古的元素，圆形标志是金沙遗址博物馆的镇馆之宝“太阳神鸟金饰”的图案，围绕着太阳神鸟图案的正方形则象征着考古中使用的探方。
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