努尔哈赤后期自掌两黄旗，打算留给阿济格、多尔衮、多铎这三个小儿子。皇太极掌正白旗，杜度掌镶白旗，代善掌正红旗，岳讬、硕讬掌镶红旗，莽古尔泰掌正蓝旗，阿敏掌镶蓝旗。
后来努尔哈赤把杜度调到镶红旗，打算把两黄旗和镶白旗都给多尔衮三兄弟，让他们一人一旗，但是没来得及操作就死了，于是皇太极继位后拿到了镶白旗，把自己嫡系的两白旗和两黄旗旗号颜色对调。阿济格、多尔衮管镶白旗，多铎管正白旗。
阿敏被囚后，济尔哈朗接管镶蓝旗。莽古尔泰、德格类接连暴死，皇太极把正蓝旗和两黄旗混编，以豪格为正蓝旗旗主，阿巴泰为小旗主。
多尔衮上台后夺了多铎一半兵马，变成多尔衮管正白旗，阿济格、多铎管镶白旗。
硕讬被杀，他的兵力给了皇太极的庶子硕塞，还在镶红旗。豪格死后，多尔衮吞并正蓝旗。
多铎死了，多尔衮又把正蓝旗和镶白旗混编，镶白旗归自己执掌，阿巴泰、阿济格、多铎这三支组成了新的正蓝旗。
多尔衮死后，顺治把正白旗收归自己，镶白旗给了豪格的后人。阿济格被杀，其兵马分给两白旗和正蓝旗，至此八旗基本定型。
总结：
正黄旗其实是原来莽古尔泰的正蓝旗；
镶黄旗是原来皇太极嫡系的正白旗；
正白旗是多尔衮最初所在的原努尔哈赤正黄旗；
镶白旗主干源出最初褚英一脉的镶白旗，折腾了一大圈，又变回镶白旗；
正红旗一直是代善一脉执掌，从未变过；
镶红旗也一直是岳讬一脉执掌，从未变过；
正蓝旗的主干本来是努尔哈赤最嫡系的镶黄旗，最后变成了大杂烩；
镶蓝旗始终是舒尔哈齐一脉执掌，从未变过。
