首先是和无氧氧化相同的起始途径糖酵解:①葡萄糖经己糖激酶的催化和Mg2+协助下消耗一份ATP不可逆生成葡糖－6－磷酸②经磷酸己糖异构酶生成果糖－6－磷酸③磷酸果糖激酶－1催化消耗一份ATP在Mg2+协助不可逆生成果糖－1，6－二磷酸④醛缩酶催化分解为各一分子的磷酸二羟丙酮和3－磷酸甘油醛(当3－磷酸甘油醛在接下来步骤反应掉后，磷酸二羟丙酮会经磷酸丙糖异构酶催化转变为互为同分异构体的3－磷酸甘油醛)⑤3－磷酸甘油醛经3－磷酸甘油醛脱氢酶催化生成1，3－二磷酸甘油酸⑥经磷酸甘油酸激酶和Mg2+协助催化生成3－磷酸甘油酸，同时释放pi结合ADP生成ATP⑦经磷酸甘油酸变位酶催化和Mg2+协助生成2－磷酸甘油酸⑧经烯醇化酶催化成磷酸烯醇式丙酮酸⑨经丙酮酸激酶和Mg2+作用下生成丙酮酸，同时产一份ATP。
若缺氧在乳酸脱氢酶催化并接受3－磷酸甘油酸脱下的H+还原为乳酸
若氧气充足 ，第二阶段进入线粒体氧化脱羧生成乙酰CoA，第三阶段进入三羧酸循环并偶联进行氧化磷酸化。
二阶段丙酮酸+HS-CoA+NAD+→
乙酰CoA+CO2+NADH+H+
三阶段①(柠檬酸合酶对草酰乙酸Km很小）乙酰CoA(高能化合物）+草酰乙酸+H2O(糖有氧氧化反应物中六份水中的两份）→柠檬酸②（顺乌头酸酶）柠檬酸→异柠檬酸(又含两份水）③（异柠檬酸脱氢酶）异柠檬酸→α-酮戊二酸，产co2④（α-酮戊二酸脱氢酶复合体）α-酮戊二酸→琥珀酰CoA，产co2⑤（琥珀酰CoA合酶）琥珀酸，产GTP/ADP⑥（琥珀酸脱氢酶）延胡索酸⑦（延胡索酸酶＋水）苹果酸，终含两份水⑧（苹果酸脱氢酶）草酰乙酸
